PCR儀的特點是靈敏度高，污染是實驗中常見的問題，只要實驗室曾經擴增過某個片段，就有可能以后的實驗中發生污染。所以，我們在實驗前，可以用紫外燈破壞污染物。簡便快速，一次性加好反應，對標本的純度要求低。

  PCR儀的反應成分有模板濃度多高會導致反應的非特異行增加，不能混合其他的物質。引物濃度過高會導致模板與引物配錯，反應特性下降。使用酶量增加使反應特異性下降，如果太少，有影響產量。我們在試驗中，會使用高特異行的酶，測試會比較。