1，熒光法。化合物與細胞膜上離子通道結合后，改變離子通道狀態，通道打開，鈣離子進入細胞。進入細胞后與細胞內鈣離子熒光指示劑結合，發出熒光后酶標儀捕獲，熒光強度與進入細胞的鈣離子含量成正比。熒光指示劑多用FLuo3，Fluo3-AM是一種可以乙酰甲酯衍生物，可以穿透細胞膜進入細胞，進入細胞后被細胞內的酯酶剪切成FLuo3并滯留在細胞內，鈣離子進入細胞后與之結合，會發出較強的熒光。

　　2，發光法。水母發光蛋白復合物（Aequorin）由22kDa的水母蛋白（Apoaequorin protein）、分子氧和底物腔腸素組成。只有當鈣離子（Ca2+）與該復合物結合后，腔腸素才能被氧化生成高能量產物Coelenteramide，同時釋放出CO2和藍色熒光（——466 nm）。正是此Ca2+依賴性的反應過程（見圖1），使得腔腸素非常適用于監測活細胞內鈣離子水平。與常規的熒光鈣離子指示劑相比，其主要具有以下幾個優點，1）能檢測較大范圍的鈣濃度 – 從0.1 μM至 >100μM；2）樣品無自體熒光，背景熒光低于使用熒光鈣離子指示劑；雖然信號比使用熒光鈣離子指示劑弱，但是通過成像儀器可以得到更高的信噪比，因此具有更高的靈敏度。3）水母發光蛋白復合體能夠穩定維持在細胞內，使其能夠進行數小時至數天的鈣離子監測。